Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCGF3Q3KNV8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCGF3Q3KNV8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms