Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPROQ16827 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPROQ16827 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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