Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDK4Q16654 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDK4Q16654 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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