Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRY1Q16526 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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CRY1Q16526 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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CRY1Q16526 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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CRY1Q16526 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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CRY1Q16526 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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CRY1Q16526 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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CRY1Q16526 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRY1Q16526 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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