Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NCF4Q15080 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCF4Q15080 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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