Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KARSQ15046 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KARSQ15046 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KARSQ15046 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KARSQ15046 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KARSQ15046 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KARSQ15046 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KARSQ15046 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KARSQ15046 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KARSQ15046 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KARSQ15046 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KARSQ15046 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KARSQ15046 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KARSQ15046 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KARSQ15046 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KARSQ15046 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KARSQ15046 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KARSQ15046 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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