Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC1AQ14683 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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