Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNTA1Q13424 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNTA1Q13424 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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