Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4Q12950 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXD4Q12950 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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