Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE4DQ08499 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4DQ08499 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms