Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXM1Q08050 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXM1Q08050 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXM1Q08050 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms