Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OC90Q02509 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OC90Q02509 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OC90Q02509 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OC90Q02509 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OC90Q02509 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms