Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DEFA6Q01524 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms