Protein–RNA interactions for Protein: P78344

EIF4G2, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G2P78344 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 29.3
EIF4G2P78344 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.374e-23■■■■■ 29.3
EIF4G2P78344 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 29.3
EIF4G2P78344 PIN1-202ENST00000380889 1670 ntTSL 1 (best)32.59■■■□□ 2.814e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.884e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.384e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PIN1-203ENST00000585442 705 ntTSL 522.11■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PIN1-205ENST00000586352 755 ntTSL 321.94■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PIN1-204ENST00000586025 4022 ntTSL 220.91■□□□□ 0.944e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PIN1-208ENST00000589058 536 ntTSL 319.88■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PIN1-209ENST00000590540 702 ntTSL 317.34■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PIN1-210ENST00000591777 533 ntTSL 315.85■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.463e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 229.89■■■□□ 2.383e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.77□□□□□ -1.496e-24■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.029e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.329e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.299e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 CLPTM1L-214ENST00000513250 567 ntTSL 319.75■□□□□ 0.759e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 CLPTM1L-203ENST00000503151 627 ntTSL 318.38■□□□□ 0.539e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 CLPTM1L-210ENST00000508765 631 ntTSL 317.67■□□□□ 0.429e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 CLPTM1L-202ENST00000503042 3540 ntTSL 215.57■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.214e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.814e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PCGF2-205ENST00000618506 1196 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 431.8■■■□□ 2.688e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.378e-7■■■■■ 29.2
EIF4G2P78344 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.752e-6■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.478e-7■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 323.26■■□□□ 1.318e-7■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.94■■■□□ 2.062e-6■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 ATP9B-207ENST00000586672 583 ntTSL 420.31■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 29.9□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 29.55□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 TMEM74B-202ENST00000429036 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.34■■□□□ 1.173e-10■■■■■ 29.1
EIF4G2P78344 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 28.9
EIF4G2P78344 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 28.9
EIF4G2P78344 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-6■■■■■ 28.9
EIF4G2P78344 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 28.8
EIF4G2P78344 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 28.8
EIF4G2P78344 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 28.8
EIF4G2P78344 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 28.8
EIF4G2P78344 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 28.8
EIF4G2P78344 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 28.8
EIF4G2P78344 GATA2-205ENST00000492608 844 ntTSL 326.62■■□□□ 1.858e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 GATA2-206ENST00000498200 563 ntTSL 225.51■■□□□ 1.678e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 NEK6-209ENST00000444973 790 ntTSL 538.98■■■■□ 3.838e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 C20orf27-203ENST00000399672 1734 ntAPPRIS P1 TSL 236.54■■■■□ 3.448e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 NEK6-211ENST00000454453 732 ntTSL 334.89■■■■□ 3.188e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.968e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 SLC27A1-209ENST00000600297 1163 ntTSL 232.44■■■□□ 2.788e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.698e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.598e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 SLC27A1-208ENST00000600277 1423 ntTSL 231.13■■■□□ 2.578e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.548e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 CAPRIN2-212ENST00000541765 630 ntTSL 530.57■■■□□ 2.488e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 EXOC3L4-205ENST00000560102 563 ntTSL 330.15■■■□□ 2.428e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 CLIC4-204ENST00000497755 672 ntTSL 329.85■■■□□ 2.378e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 AFF1-206ENST00000507468 1486 ntTSL 1 (best)29.6■■■□□ 2.338e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 DNAAF5-203ENST00000437419 585 ntTSL 528.44■■■□□ 2.148e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 RAB3IL1-205ENST00000531922 866 ntTSL 328.34■■■□□ 2.138e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 STXBP1-214ENST00000635950 2771 ntTSL 528.07■■■□□ 2.088e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.068e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.958e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.98e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 STXBP1-210ENST00000627871 538 ntTSL 326.67■■□□□ 1.868e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 STXBP1-213ENST00000630492 572 ntTSL 526.67■■□□□ 1.868e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.868e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 SLC27A1-206ENST00000599380 2596 ntTSL 526.45■■□□□ 1.828e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 METTL22-201ENST00000163678 1510 ntTSL 1 (best)25.27■■□□□ 1.641e-6■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.598e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 GPR68-201ENST00000529102 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)24.5■■□□□ 1.518e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.511e-12■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 METTL22-216ENST00000568967 1672 ntTSL 224.02■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 EXOC3L4-202ENST00000559116 460 ntTSL 523.84■■□□□ 1.418e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 CASZ1-208ENST00000492173 2267 ntTSL 223.82■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 AFF1-204ENST00000503477 1478 ntTSL 223.74■■□□□ 1.398e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 GPR68-202ENST00000529300 435 ntTSL 523.53■■□□□ 1.368e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 TSPO-205ENST00000472378 495 ntTSL 223.45■■□□□ 1.348e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.298e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.288e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 SPPL2B-202ENST00000586111 390 ntTSL 323.05■■□□□ 1.288e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 222.37■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 AFF1-205ENST00000504956 1668 ntTSL 222.31■■□□□ 1.168e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.158e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 NCBP3-207ENST00000577169 645 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.118e-7■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 28.7
EIF4G2P78344 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.078e-7■■■■■ 28.7
Retrieved 100 of 8,962 protein–RNA pairs in 195 ms