RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600297.1

SLC27A1-209, Transcript of solute carrier family 27 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC27A1, Length 1,163 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1-209ENST00000600297 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.33■■■■■ 6.61
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SLC27A1-209ENST00000600297 ABCC9O60706 1549 aa50.01■■■■■ 5.6
SLC27A1-209ENST00000600297 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.85■■■■■ 5.25
SLC27A1-209ENST00000600297 NACADO15069 1562 aa47.58■■■■■ 5.21
SLC27A1-209ENST00000600297 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.37■■■■■ 5.17
SLC27A1-209ENST00000600297 MYO15BQ96JP2 1530 aa47■■■■■ 5.12
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SLC27A1-209ENST00000600297 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.69■■■■■ 5.06
SLC27A1-209ENST00000600297 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.54■■■■■ 5.04
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SLC27A1-209ENST00000600297 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.37■■■■■ 5.01
SLC27A1-209ENST00000600297 SCRIBQ14160 1630 aa46.03■■■■■ 4.96
SLC27A1-209ENST00000600297 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.8■■■■■ 4.92
SLC27A1-209ENST00000600297 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.24■■■■■ 4.83
SLC27A1-209ENST00000600297 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.23■■■■■ 4.83
SLC27A1-209ENST00000600297 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.99■■■■■ 4.79
SLC27A1-209ENST00000600297 SMARCA4P51532 1647 aa43.94■■■■■ 4.62
SLC27A1-209ENST00000600297 NCAPD3P42695 1498 aa43.83■■■■■ 4.61
SLC27A1-209ENST00000600297 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.77■■■■■ 4.6
SLC27A1-209ENST00000600297 SMARCA2P51531 1590 aa43.76■■■■■ 4.6
SLC27A1-209ENST00000600297 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
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SLC27A1-209ENST00000600297 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.46■■■■■ 4.55
SLC27A1-209ENST00000600297 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
SLC27A1-209ENST00000600297 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.41■■■■■ 4.54
SLC27A1-209ENST00000600297 ERCC6Q03468 1493 aa43.19■■■■■ 4.51
SLC27A1-209ENST00000600297 NESP48681 1621 aa43.06■■■■■ 4.48
SLC27A1-209ENST00000600297 WIZO95785 1651 aa43■■■■■ 4.47
SLC27A1-209ENST00000600297 CUX2O14529 1486 aa42.94■■■■■ 4.47
SLC27A1-209ENST00000600297 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.9■■■■■ 4.46
SLC27A1-209ENST00000600297 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.46
SLC27A1-209ENST00000600297 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.67■■■■■ 4.42
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SLC27A1-209ENST00000600297 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.2■■■■■ 4.35
SLC27A1-209ENST00000600297 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.14■■■■■ 4.34
SLC27A1-209ENST00000600297 CFTRP13569 1480 aa42.13■■■■■ 4.34
SLC27A1-209ENST00000600297 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.1■■■■■ 4.33
SLC27A1-209ENST00000600297 WDR62O43379 1518 aa42.09■■■■■ 4.33
SLC27A1-209ENST00000600297 PRDM2Q13029 1718 aa42.03■■■■■ 4.32
SLC27A1-209ENST00000600297 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.96■■■■■ 4.31
SLC27A1-209ENST00000600297 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
SLC27A1-209ENST00000600297 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
SLC27A1-209ENST00000600297 TOPBP1Q92547 1522 aa41.35■■■■■ 4.21
SLC27A1-209ENST00000600297 ABCC8Q09428 1581 aa41.3■■■■■ 4.2
SLC27A1-209ENST00000600297 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.29■■■■■ 4.2
SLC27A1-209ENST00000600297 IFT140Q96RY7 1462 aa41.25■■■■■ 4.19
SLC27A1-209ENST00000600297 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
SLC27A1-209ENST00000600297 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
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SLC27A1-209ENST00000600297 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
SLC27A1-209ENST00000600297 CUX1P39880 1505 aa40.78■■■■■ 4.12
SLC27A1-209ENST00000600297 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.12
SLC27A1-209ENST00000600297 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.77■■■■■ 4.12
SLC27A1-209ENST00000600297 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.77■■■■■ 4.12
SLC27A1-209ENST00000600297 TRIM41Q8WV44 630 aa40.74■■■■■ 4.11
SLC27A1-209ENST00000600297 SOGA1O94964 1423 aa40.74■■■■■ 4.11
SLC27A1-209ENST00000600297 CHD1O14646 1710 aa40.72■■■■■ 4.11
SLC27A1-209ENST00000600297 WDR97A6NE52 1622 aa40.64■■■■■ 4.1
SLC27A1-209ENST00000600297 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
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SLC27A1-209ENST00000600297 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
SLC27A1-209ENST00000600297 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.53■■■■■ 4.08
SLC27A1-209ENST00000600297 FBLN2P98095 1184 aa40.47■■■■■ 4.07
SLC27A1-209ENST00000600297 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.45■■■■■ 4.07
SLC27A1-209ENST00000600297 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.44■■■■■ 4.06
SLC27A1-209ENST00000600297 PBRM1Q86U86 1689 aa40.41■■■■■ 4.06
SLC27A1-209ENST00000600297 ARHGEF11O15085 1522 aa40.4■■■■■ 4.06
SLC27A1-209ENST00000600297 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.39■■■■■ 4.06
SLC27A1-209ENST00000600297 TOP2BQ02880 1626 aa40.38■■■■■ 4.06
SLC27A1-209ENST00000600297 GRIN2BQ13224 1484 aa40.38■■■■■ 4.05
SLC27A1-209ENST00000600297 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
SLC27A1-209ENST00000600297 SYNJ1O43426 1573 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC27A1-209ENST00000600297 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.31■■■■■ 4.04
SLC27A1-209ENST00000600297 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC27A1-209ENST00000600297 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.27■■■■■ 4.04
SLC27A1-209ENST00000600297 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
SLC27A1-209ENST00000600297 SYNJ2O15056 1496 aa40.19■■■■■ 4.03
SLC27A1-209ENST00000600297 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.12■■■■■ 4.01
SLC27A1-209ENST00000600297 ARAP1Q96P48 1450 aa40■■■■□ 3.99
SLC27A1-209ENST00000600297 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40■■■■□ 3.99
SLC27A1-209ENST00000600297 ADAMTS12P58397 1594 aa39.95■■■■□ 3.99
SLC27A1-209ENST00000600297 GRIN2AQ12879 1464 aa39.86■■■■□ 3.97
SLC27A1-209ENST00000600297 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.84■■■■□ 3.97
SLC27A1-209ENST00000600297 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.78■■■■□ 3.96
SLC27A1-209ENST00000600297 CEP170Q5SW79 1584 aa39.72■■■■□ 3.95
SLC27A1-209ENST00000600297 NUP160Q12769 1436 aa39.67■■■■□ 3.94
SLC27A1-209ENST00000600297 KIF27Q86VH2 1401 aa39.64■■■■□ 3.94
SLC27A1-209ENST00000600297 SHROOM2Q13796 1616 aa39.53■■■■□ 3.92
SLC27A1-209ENST00000600297 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.51■■■■□ 3.92
SLC27A1-209ENST00000600297 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
SLC27A1-209ENST00000600297 IGF1RP08069 1367 aa39.45■■■■□ 3.91
SLC27A1-209ENST00000600297 CUL7Q14999 1698 aa39.44■■■■□ 3.9
SLC27A1-209ENST00000600297 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.38■■■■□ 3.89
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