Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOMO3P69849 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms