Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSNL1P62760 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSNL1P62760 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms