Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBE2HP62256 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms