Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2BFSP57053 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2BFSP57053 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms