Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EMP1P54849 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP1P54849 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP1P54849 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP1P54849 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP1P54849 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EMP1P54849 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMP1P54849 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMP1P54849 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMP1P54849 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms