Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB4P54760 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHB4P54760 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms