Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS2P54278 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS2P54278 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS2P54278 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS2P54278 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P54278 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P54278 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P54278 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P54278 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P54278 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P54278 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P54278 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P54278 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P54278 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P54278 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P54278 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P54278 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P54278 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P54278 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P54278 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P54278 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P54278 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P54278 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P54278 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P54278 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMS2P54278 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMS2P54278 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms