Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D1P51668 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D1P51668 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D1P51668 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D1P51668 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D1P51668 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms