Protein–RNA interactions for Protein: P51153

RAB13, Ras-related protein Rab-13, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB13P51153 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB13P51153 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB13P51153 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB13P51153 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB13P51153 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB13P51153 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB13P51153 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB13P51153 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB13P51153 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB13P51153 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB13P51153 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB13P51153 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms