Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AMTP48728 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AMTP48728 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMTP48728 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMTP48728 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMTP48728 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AMTP48728 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AMTP48728 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AMTP48728 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
AMTP48728 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
AMTP48728 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AMTP48728 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AMTP48728 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms