Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX5P35711 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX5P35711 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX5P35711 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX5P35711 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOX5P35711 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SOX5P35711 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOX5P35711 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX5P35711 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX5P35711 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX5P35711 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX5P35711 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX5P35711 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX5P35711 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX5P35711 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX5P35711 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX5P35711 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX5P35711 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX5P35711 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX5P35711 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX5P35711 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX5P35711 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX5P35711 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX5P35711 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX5P35711 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX5P35711 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX5P35711 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX5P35711 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX5P35711 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX5P35711 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX5P35711 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms