Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF2P35227 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF2P35227 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms