Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SRIP30626 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRIP30626 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRIP30626 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRIP30626 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRIP30626 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRIP30626 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms