Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLNP26678 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLNP26678 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLNP26678 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLNP26678 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLNP26678 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLNP26678 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms