Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LAMA1P25391 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA1P25391 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms