Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR1P24390 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR1P24390 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms