Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
S100A1P23297 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
S100A1P23297 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
S100A1P23297 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
S100A1P23297 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
S100A1P23297 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
S100A1P23297 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
S100A1P23297 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
S100A1P23297 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
S100A1P23297 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
S100A1P23297 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
S100A1P23297 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
S100A1P23297 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
S100A1P23297 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
S100A1P23297 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
S100A1P23297 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
S100A1P23297 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
S100A1P23297 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
S100A1P23297 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
S100A1P23297 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
S100A1P23297 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
S100A1P23297 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
S100A1P23297 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms