Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP2B1P20020 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms