Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATF1P18846 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATF1P18846 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATF1P18846 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATF1P18846 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATF1P18846 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATF1P18846 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATF1P18846 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATF1P18846 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATF1P18846 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATF1P18846 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATF1P18846 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATF1P18846 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF1P18846 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATF1P18846 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATF1P18846 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF1P18846 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF1P18846 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATF1P18846 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATF1P18846 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATF1P18846 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF1P18846 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF1P18846 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF1P18846 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATF1P18846 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF1P18846 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF1P18846 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF1P18846 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF1P18846 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATF1P18846 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms