Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTPS1P17812 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS1P17812 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms