Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA4P13612 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms