Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM1P13164 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM1P13164 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms