Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
PTPRFP10586 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRFP10586 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms