Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PGA3P0DJD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGA3P0DJD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms