Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IFNA4P05014 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFNA4P05014 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms