Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IFNA21P01568 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IFNA21P01568 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms