Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZBED1O96006 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZBED1O96006 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZBED1O96006 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
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