Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB2O95900 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB2O95900 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms