Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF12O95522 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF12O95522 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms