Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RAPGEF3O95398 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RAPGEF3O95398 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
RAPGEF3O95398 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAPGEF3O95398 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAPGEF3O95398 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAPGEF3O95398 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAPGEF3O95398 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAPGEF3O95398 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RAPGEF3O95398 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms