Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LTN1O94822 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LTN1O94822 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LTN1O94822 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LTN1O94822 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTN1O94822 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTN1O94822 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTN1O94822 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LTN1O94822 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTN1O94822 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTN1O94822 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTN1O94822 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTN1O94822 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTN1O94822 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LTN1O94822 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTN1O94822 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTN1O94822 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTN1O94822 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LTN1O94822 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LTN1O94822 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LTN1O94822 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTN1O94822 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTN1O94822 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTN1O94822 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTN1O94822 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LTN1O94822 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
LTN1O94822 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LTN1O94822 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LTN1O94822 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LTN1O94822 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LTN1O94822 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LTN1O94822 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LTN1O94822 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LTN1O94822 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LTN1O94822 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LTN1O94822 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LTN1O94822 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LTN1O94822 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LTN1O94822 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms