Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCTN3O75935 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DCTN3O75935 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCTN3O75935 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCTN3O75935 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCTN3O75935 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCTN3O75935 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCTN3O75935 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCTN3O75935 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCTN3O75935 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DCTN3O75935 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN3O75935 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN3O75935 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN3O75935 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN3O75935 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN3O75935 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN3O75935 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN3O75935 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCTN3O75935 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCTN3O75935 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCTN3O75935 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms