Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRCH4O75427 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRCH4O75427 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms