Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB11FIP3O75154 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAB11FIP3O75154 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms