Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF40O75150 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF40O75150 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF40O75150 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF40O75150 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF40O75150 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF40O75150 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF40O75150 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF40O75150 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF40O75150 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RNF40O75150 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RNF40O75150 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RNF40O75150 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF40O75150 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF40O75150 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF40O75150 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF40O75150 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF40O75150 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF40O75150 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF40O75150 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF40O75150 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms